Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS37CA5D8V6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms