Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNND2Q9UQB3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms