Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms