Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TSR3Q9UJK0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms