Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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