Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms