Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SSU72Q9NP77 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms