Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC13A1Q9BZW2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC13A1Q9BZW2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms