Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM43Q9BTV4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms