Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FYCO1Q9BQS8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms