Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms