Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A12Q96S37 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms