Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGCZQ96LD1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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