Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms