Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYTL4Q96C24 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL4Q96C24 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL4Q96C24 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL4Q96C24 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYTL4Q96C24 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms