Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms