Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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GTF3C6Q969F1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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GTF3C6Q969F1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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GTF3C6Q969F1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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