Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms