Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms