Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms