Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL3Q8IVW4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms