Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF6Q5VXH4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms