Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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