Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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LAMA3Q16787 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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