Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms