Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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