Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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NCAPHQ15003 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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