Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD11Q14690 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms