Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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