Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms