Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms