Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms