Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIN1Q05586 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms