Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms