Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG7P83436 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG7P83436 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG7P83436 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG7P83436 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG7P83436 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG7P83436 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms