Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms