Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms