Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA4P13612 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms