Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB1P04280 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms