Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24BO95487 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24BO95487 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms