Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP4O75379 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms