Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP9BO43861 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms