Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIAH2O43255 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms