Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHOX2AO14813 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms