Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms