Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAD1L1Q9Y6D9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms