Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH4Q9UQ05 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms