Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTF2Q9UNY4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms