Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF346Q9UL40 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms