Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms